Le parcours narratif suit deux fils conducteurs. D’un côté, il révèle les origines de la Basilique et son développement autour de la tombe de Saint-Pierre. De l’autre, il accompagne le visiteur à travers les principales étapes de la vie de l’Apôtre jusqu’à son martyre. L’histoire de Pierre est intimement liée à celle de la Basilique, présentée à travers ses évolutions au fil des siècles.